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2025년 세제개편안, 우리 회사에 끼칠 영향은?

2025년 세제개편안, 우리 회사에 끼칠 영향은?

안녕하세요. 헬프미 법률사무소입니다.

2025년 7월 31일, 정부가 기업의 미래 전략과 재무 계획에 중대한 영향을 미칠 '2025년 세제개편안'을 발표했습니다. 이번 개편의 핵심은 '성장을 위한 선별 지원'과 '세수 기반 정상화'로 요약됩니다. AI, K-콘텐츠 등 미래 산업에 대한 지원을 강화하는 동시에, 법인세율 등을 과거 수준으로 환원하여 전반적인 세 부담 증가가 예상됩니다.

헬프미 법률사무소에서 이번 개편안의 내용을 법인 경영자의 관점에서 심층 분석하고, 위기를 기회로 바꿀 대응 전략을 제시합니다.

1. 적색경보: 세 부담 증가

가장 직접적인 변화는 세금 부담 증가입니다. 안정적 세입 기반을 확보하기 위해 법인세율 등이 '22년 이전 수준으로 돌아갑니다.

2025년 세제개편안 - 법인세율, 증권거래세율
구분 과세표준 / 시장 현행 개정
법인세율 ('26.1.1. 이후 개시 사업연도부터) 2억 원 이하 9% 10%
2억 원 초과 ~ 200억 원 이하 19% 20%
200억 원 초과 ~ 3,000억 원 이하 21% 22%
3,000억 원 초과 24% 25%
증권거래세율 (시행령 시행일 이후 양도분부터) 코스피 (KOSPI) 0% 0.05%
코스닥 (KOSDAQ) 0.15% 0.20%

특히, 정부는 상장주식 양도소득세가 부과되는 대주주 기준을 종목당 보유금액 50억 원에서 다시 10억 원으로 환원하겠다고 발표했습니다. 하지만 이 발표 직후 증시가 급락하고 논란이 일자, 8월 5일 여당인 더불어민주당은 해당 개편안을 원점에서 재검토하겠다는 입장을 밝혔습니다.

✅ 헬프미's 전략 Tip
법인세율 1%p 인상은 가능성 높게 대비해야 할 가장 중요한 변화입니다. 반면, 주식 양도소득세 대주주 기준 강화(50억→10억)는 현재 여당의 '원점 재검토' 발표로 인해 최종안이 어떻게 결정될지 불투명해졌습니다. 이 부분의 입법 과정을 계속 주시하며 여러 시나리오에 대비한 투자, 절세 전략을 마련해 두시는 것이 중요합니다.

2. 새로운 기회: 미래 성장 동력과 자본시장에 대한 지원

정부는 세금 부담을 늘리는 동시에, 특정 미래 산업 분야와 자본시장 활성화를 위한 파격적인 세제 혜택이라는 기회의 문을 열었습니다.

2.1. 신성장 동력 ①: AI 및 미래형 운송 기술

인공지능(AI)과 미래형 운송 기술이 '국가전략기술'로 지정되어 최고 수준의 세제 혜택을 받게 됩니다.

  • R&D 세액공제: 생성형 AI, 자율운항 기술 등 관련 R&D 비용에 대해 높은 공제율을 적용받습니다.
  • 시설투자 세액공제: AI 서비스를 위한 데이터센터, 자율운항 기술 관련 설비 제작·실증 시설 등에 투자하는 금액의 25%(중소기업 기준)를 공제받을 수 있습니다.
  • 적용 시점: 대부분 2025년 7월 1일 이후 투자분부터 적용되나, AI 및 AI 기반 자율운항 관련 기술·시설은 2025년 1월 1일 투자분부터 소급 적용됩니다.

2.2. 신성장 동력 ②: K-콘텐츠 산업

웹툰 산업의 글로벌 경쟁력 강화를 위해, 영상 콘텐츠에 이어 웹툰 제작비용에 대한 세액공제 제도가 신설되었습니다.

  • 공제 대상: 작가 인건비, 원작 소설 저작권료, 웹툰 제작 프로그램 사용료 등 직접 제작에 소요된 비용 (홍보비 등 간접비 제외)
  • 공제율: 중소기업 15%, 중견·대기업 10%
  • 적용 시점: 2026년 1월 1일 이후 발생하는 비용부터 적용됩니다.

2.3. 자본시장 활성화: 고배당 기업 주주 세제 혜택

기업의 주주환원을 유도하기 위해, 고배당 기업의 주주(거주자)가 받는 배당소득에 대해 분리과세 혜택을 신설했습니다.

  • (혜택) 종합소득세(최고 45%)에 합산하지 않고, 최대 35%의 별도 세율로 과세를 종결합니다.
  • 고배당기업 요건: 전년 대비 배당액이 줄지 않으면서, ①배당성향 40% 이상 또는 ②배당성향 25% 이상 및 직전 3년 평균 대비 배당 5% 이상 증가 요건을 충족하는 상장법인 등이 해당됩니다.
  • (시사점) 비상장 중소기업에 직접 적용되진 않으나, 대표님의 개인 투자 전략 수립에 참고할 수 있으며 향후 IPO를 고려할 때 중요한 정책 방향성을 보여줍니다.

3. 고용 전략 대전환: '추징 없는' 고용세액공제

기업의 인력 운용에 가장 큰 영향을 미치는 통합고용세액공제가 '장기 고용 친화적'으로 전면 개편됩니다.

3.1. '추징' 부담 해소

가장 큰 변화입니다. 기존에는 공제받은 후 고용이 줄면 세금을 다시 토해내야 했지만, 앞으로는 고용이 감소해도 과거에 받은 혜택을 추징하지 않습니다.

3.2. '장기 고용' 인센티브 강화

고용을 유지할수록 혜택이 커지는 누진 공제 방식으로 재설계되었습니다. 1년차보다 2, 3년차에 더 많은 금액을 공제해 지속적인 고용 유지를 유도합니다.

3.3. '상시근로자' 기준 합리화

기존 '근로계약 기간 1년 이상'에서 '실제 근로기간 1년 이상'으로 기준이 바뀌어, 보다 현실적인 고용 형태를 반영하게 되었습니다.

(1인당 공제액, 단위: 만원) 중소기업 (수도권) 중소기업 (지방)
우대 (청년 등) 3년간 총 3,750 (700+1,600+1,700) 3년간 총 4,950 (1,000+1,900+2,000)
기본 3년간 총 2,350 (400+900+1,000) 3년간 총 3,250 (700+1,200+1,300)
✅ 헬프미's 전략 Tip
추징 리스크가 사라졌으므로, 이제 더 과감하게 고용세액공제를 신청할 수 있습니다. 단기적인 인력 변동 우려보다, 장기적인 고용 유지를 통해 더 큰 세금 절감 효과를 누리는 방향으로 인사 전략을 수립해야 합니다. (적용 시점: '26.1.1. 이후 개시 과세연도를 최초 공제연도로 하여 신청하는 분부터)

4. 안정적 경영 지원: 연장 및 확대되는 제도들

기존의 유용한 제도들 역시 적용기한이 연장되거나 범위가 확대되어 경영의 안정성을 더했습니다.

  • 해외진출기업 국내 복귀(U-Turn) 지원 강화: 기존에는 해외 사업장을 먼저 축소한 후 국내에 복귀해야 세제 혜택을 받을 수 있었으나, 앞으로는 국내에 먼저 복귀한 후 4년 내에 해외 사업장을 축소해도 동일한 감면 혜택을 받을 수 있게 되어 유연한 사업 재편이 가능해졌습니다.
  • 지방이전 기업 세제지원 확대: 수도권에서 지방으로 공장·본사를 이전할 경우, 이전 지역과 기업 규모에 따라 최대 10년간 100% + 추가 5년간 50%의 법인세 감면을 받을 수 있도록 감면 기간과 대상이 확대되었습니다.
  • 벤처투자조합의 SPC를 통한 투자 지원: 벤처투자조합이 100% 출자한 투자목적회사(SPC)를 통해 벤처기업에 투자하는 경우에도, 기존의 직접 투자와 동일한 비과세 및 세액공제 혜택을 적용받게 되어 투자 구조 설계의 폭이 넓어졌습니다.
  • 프로젝트 리츠(REITs) 현물출자 과세특례 신설: 부동산 PF 시장 안정을 위해, 개인이 프로젝트 리츠에 토지·건물을 현물출자하는 경우 발생한 양도차익에 대한 과세를 주식 처분 시점까지 이연해주는 특례가 신설되었습니다.

5. CEO의 선제적 대응이 필요한 때

이번 세제개편안은 8월 14일까지 입법예고된 뒤, 9월 초 정기 국회에 제출될 예정입니다. 지금은 우리 회사에 미칠 영향을 분석하고 2026년을 위한 선제적인 경영 전략을 수립해야 할 때입니다.

  • 모든 기업: 법인세율 인상에 대비한 재무 계획 수정이 필요합니다.
  • 기술·콘텐츠 기업: 자사의 기술과 사업이 국가전략기술에 포함되는지 확인하고, R&D 및 투자 전략을 세워야 합니다.
  • 대주주 및 주식 투자자: 주식 양도소득세 대주주 기준 환원 논의는 현재 진행형이므로, 입법 과정을 주시하며 지분 관리 및 투자 전략을 재검토해야 합니다.

헬프미 법률사무소는 대형로펌 출신 박효연 변호사(사시 48회, 서울대 법대 졸업), 이상민 변호사(고려대 법대 졸업, 사시 49회)가 설립, 운영하며, 기업 운영의 복잡한 법률 및 세무 이슈에 대해 명쾌한 가이드를 제공하여 대표님들이 비즈니스의 본질에만 집중하실 수 있도록 돕겠습니다.